查干湖自然保护区是吉林省人民政府1986年批准成立的省级自然保护区。保护区面积为480平方公里，大部分在开发区境内。

      保护区核心区位于辛甸泡，泡内生满芦苇，是鸟类主要栖息场所；缓冲区位于查干湖夹芯子岛以北至辛甸泡水域；生产实验区位于新庙泡、库里泡、菱角泡和查干湖夹芯子岛以南水域。

　　保护区内现有鸟类有15目34科116种，占全省鸟类总数的35.6%，其中水鸟有13科58种，占本区鸟类总种数的50%。属国家Ⅰ级保护的有白枕鹤、白头鹤、丹顶鹤等5种；属国家Ⅱ级保护的有白天鹅、雀鹰、灰鹤等12种。

　　两栖类有1目3科4种，爬行类有2目3科4种，兽类

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