新疆医科大学是1998年4月经国家教育部批准，由原新疆医学院与新疆中医学院合并，于同年9月10日正式挂牌成立的。江泽民同志亲自为新疆医科大学题写了校名。新疆中医学院的前身是建于1961年的中医学校，1986年升格为中医学院。原新疆医学院始建于1954年，1956年建成招生，为前苏联援助我国第一个五年计划156个重点项目之一。
　　全校占地总面积2696亩，其中校本部占地面积2031.3亩(教学区360.1亩，家属区183.5亩，鲤鱼山1450亩，明园校区22.5亩，高职学院校区15.2亩 )，各附院占地面积664.3亩（第五附属医院63.4亩）。全校建筑总面积71.55万平方米，其中校本部建筑面积27.96万平方米，生均教学行政用房10.55平方米，较国家教育部要求的生均16方米的标准还差5.45平方米。全校固定资产从1998年的4.73亿元上升到现在的11.76亿元，其中校本部由1998年的1